Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAEP38570 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms