Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms