Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX9Q9Y5X1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms