Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
YIPF1Q9Y548 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF1Q9Y548 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms