Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAF6Q9Y4K3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAF6Q9Y4K3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF6Q9Y4K3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms