Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
R3HCC1Q9Y3T6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms