Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL20Q9Y2M5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL20Q9Y2M5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms