Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1Q9Y2A7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms