Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BTRCQ9Y297 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BTRCQ9Y297 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BTRCQ9Y297 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BTRCQ9Y297 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BTRCQ9Y297 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BTRCQ9Y297 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms