Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF13BQ9Y275 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms