Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS5Q9UPZ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms