Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO6Q9UM54 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms