Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF490Q9ULM2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF490Q9ULM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF490Q9ULM2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms