Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV3Q9UKW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms