Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AMFRQ9UKV5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms