Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCTPQ9UKL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCTPQ9UKL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms