Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRLS1Q9UJA2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms