Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPA4Q9UI42 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA4Q9UI42 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms