Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.76■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
MLH3Q9UHC1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MLH3Q9UHC1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MLH3Q9UHC1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms