Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3BQ9UH17 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms