Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AIPL1Q9NZN9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AIPL1Q9NZN9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms