Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GGA3Q9NZ52 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GGA3Q9NZ52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms