Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D2Q9NY47 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D2Q9NY47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D2Q9NY47 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms