Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL12Q9NXK8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL12Q9NXK8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms