Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM260Q9NX78 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM260Q9NX78 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM260Q9NX78 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms