Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms