Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRNAU1APQ9NX07 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms