Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCP11L1Q9NUJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms