Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM60AQ9NP50 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM60AQ9NP50 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM60AQ9NP50 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM60AQ9NP50 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM60AQ9NP50 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM60AQ9NP50 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms