Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP110Q9HB58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP110Q9HB58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms