Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRPEL1Q9HAV7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRPEL1Q9HAV7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms