Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF1Q9H9Y2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF1Q9H9Y2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF1Q9H9Y2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF1Q9H9Y2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPF1Q9H9Y2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPF1Q9H9Y2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPF1Q9H9Y2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPF1Q9H9Y2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms