Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG1Q9H6L5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG1Q9H6L5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms