Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL31Q9H511 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL31Q9H511 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms