Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF3Q9H4W6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EBF3Q9H4W6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF3Q9H4W6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms