Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM117Q9H0C3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms