Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP44Q9C0F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP44Q9C0F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP44Q9C0F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms