Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP74Q9C0B2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP74Q9C0B2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms