Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms