Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR2Q9BYE9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR2Q9BYE9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms