Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLVAPQ9BX97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLVAPQ9BX97 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms