Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KATNB1Q9BVA0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms