Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS4Q9BT78 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS4Q9BT78 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms