Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2AQ9BSW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms