Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-207ENST00000586937 579 ntTSL 227.65■■■□□ 2.021e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.019e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.999e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NRBP2-207ENST00000531729 1064 ntTSL 1 (best)27.49■■□□□ 1.999e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.999e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NRBP2-205ENST00000530123 925 ntTSL 1 (best)27.44■■□□□ 1.983e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.969e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.929e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.869e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CHFR-222ENST00000544093 942 ntTSL 326.61■■□□□ 1.859e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NDUFAF6-206ENST00000518258 1373 ntTSL 226.43■■□□□ 1.823e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.819e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-216ENST00000589780 587 ntTSL 426.04■■□□□ 1.769e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-214ENST00000586084 553 ntTSL 426.04■■□□□ 1.769e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.739e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NCAPD3-202ENST00000525485 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 425.84■■□□□ 1.739e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NDUFAF6-204ENST00000454358 946 ntTSL 525.8■■□□□ 1.723e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NDUFAF6-205ENST00000517976 1196 ntTSL 525.72■■□□□ 1.713e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.79e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 BLCAP-207ENST00000414080 581 ntTSL 325.58■■□□□ 1.699e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ENKD1-204ENST00000602531 888 ntTSL 325.53■■□□□ 1.689e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 USF2-204ENST00000593708 474 ntTSL 325.53■■□□□ 1.689e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MBD3-208ENST00000590830 1035 ntTSL 1 (best)25.5■■□□□ 1.679e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.641e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.629e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PKN1-210ENST00000587429 562 ntTSL 425.05■■□□□ 1.69e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.69e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MGAT4B-216ENST00000520969 1096 ntTSL 324.93■■□□□ 1.589e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 STK11IP-209ENST00000473899 615 ntTSL 224.79■■□□□ 1.561e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.559e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DYRK2-206ENST00000543747 568 ntTSL 424.74■■□□□ 1.559e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PKN1-207ENST00000586557 899 ntTSL 524.73■■□□□ 1.559e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.529e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-205ENST00000586275 695 ntTSL 324.52■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.511e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NFKB2-202ENST00000336486 851 ntTSL 323.89■■□□□ 1.419e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 223.84■■□□□ 1.419e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-213ENST00000451231 2163 ntTSL 223.55■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NDUFAF6-211ENST00000520757 1474 ntTSL 223.46■■□□□ 1.353e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.349e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ASPDH-204ENST00000597030 539 ntTSL 223.41■■□□□ 1.349e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.339e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-210ENST00000438091 1208 ntTSL 523.2■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 USF2-210ENST00000598058 510 ntTSL 223.11■■□□□ 1.292e-8■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MGAT4B-205ENST00000518778 1568 ntTSL 1 (best)23.01■■□□□ 1.275e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-206ENST00000565406 691 ntTSL 222.93■■□□□ 1.269e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.251e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SLC6A11-203ENST00000464828 570 ntTSL 322.72■■□□□ 1.239e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.179e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 STUB1-207ENST00000566181 510 ntTSL 322.28■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NFKB2-205ENST00000467116 1634 ntTSL 222.16■■□□□ 1.149e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.139e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.129e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-214ENST00000451271 2284 ntTSL 1 (best)22.06■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.119e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-230ENST00000498214 2346 ntTSL 221.94■■□□□ 1.17e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NRBP2-203ENST00000527545 2546 ntTSL 221.92■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-209ENST00000436503 1445 ntTSL 1 (best)21.91■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAP4K2-206ENST00000439069 947 ntTSL 321.88■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MGAT4B-209ENST00000519836 1686 ntTSL 1 (best)21.86■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TBX2-AS1-204ENST00000591313 640 ntTSL 221.86■■□□□ 1.099e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 421.86■■□□□ 1.099e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MGAT4B-220ENST00000522451 583 ntTSL 221.77■■□□□ 1.089e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-216ENST00000461995 862 ntTSL 321.74■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-210ENST00000599657 534 ntTSL 421.63■■□□□ 1.059e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.059e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PKN1-203ENST00000585619 582 ntTSL 521.6■■□□□ 1.059e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PKN1-212ENST00000590097 848 ntTSL 321.6■■□□□ 1.059e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.059e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-225ENST00000483582 2467 ntTSL 1 (best)21.46■■□□□ 1.037e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 BLCAP-210ENST00000445723 588 ntTSL 421.31■■□□□ 19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 521.28■■□□□ 19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 19e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APH1A-201ENST00000236017 663 ntTSL 221.26■□□□□ 0.999e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 221.23■□□□□ 0.999e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CHD3-214ENST00000572579 931 ntTSL 221.21■□□□□ 0.999e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.979e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXYD1-207ENST00000589121 512 ntTSL 321.07■□□□□ 0.969e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-227ENST00000494365 2499 ntTSL 221.05■□□□□ 0.967e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF335-202ENST00000475002 1721 ntTSL 221.04■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAP4K2-204ENST00000433890 2410 ntTSL 520.98■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.949e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-206ENST00000589073 1703 ntTSL 520.87■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ASPDH-205ENST00000597232 531 ntTSL 220.81■□□□□ 0.929e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.929e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.929e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.929e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.899e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.899e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SMYD5-201ENST00000258100 786 ntTSL 520.5■□□□□ 0.879e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXYD1-210ENST00000592818 959 ntTSL 520.49■□□□□ 0.879e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.859e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.859e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-217ENST00000464406 807 ntTSL 220.19■□□□□ 0.829e-7■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 626.6 ms