Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC77Q9BR77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC77Q9BR77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms