Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
FYCO1Q9BQS8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FYCO1Q9BQS8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms