Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC5LQ99459 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC5LQ99459 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CDC5LQ99459 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC5LQ99459 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC5LQ99459 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms