Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIGSQ96S52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIGSQ96S52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms