Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ALS2Q96Q42 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALS2Q96Q42 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms